原则 | 说明 |
---|---|
**功能明确性** | 名称应直观反映其生物功能,如“激活因子”、“稳定因子”、“放大酶”等 |
**结构不重复性** | 保证同一类别下命名规则清晰、统一,避免不同机制间混用或模糊 |
**类别分层性** | 对通路、受体、酶、转导物等分别命名,体现信号流动链条 |
**可扩展性** | 允许将来加入新的通路或成员时无缝对接,并兼容高等系统或合成生物的拓展 |
**中文系统性** | 使用中文结构和词汇逻辑,使其成为可传播的本土化生物学语言系统 |
类别 | 命名建议结构 | 举例 / 对应术语 |
---|---|---|
`X-型通路`或 `X-信号轴` | MAPK → 放大轴通路、Notch → 邻接决策通路 | |
`X-信使` / `X-因子` | Wnt → 极性因子,TGF-β → 分化信使,EGF → 生长信使 | |
`X-感受体` / `X-转接体` | EGFR → 增殖感受体,Notch → 命运转接体,TGFβR → 分化锁受体 | |
`X-激酶` / `X-放大酶` | MEK → 中继激酶,ERK → 执行激酶,JAK → 桥接激酶 | |
`X-传导子` / `X-核信者` | STAT → 转录信使,β-catenin → 命运传导子,SMAD → 分化核信使 | |
`X-抑制因子` / `X-熄灭酶` | DUSP → 放大熄灭酶,SMAD7 → 分化阻断因子,Axin → 极性回收因子 |
元素 | 原英文术语 | 中文命名建议 | 功能逻辑说明 |
---|---|---|---|
通路名称 | MAPK Pathway | 放大轴通路 | 表示其级联放大、逐级转导结构 |
配体 | EGF | 增殖信使 | 激活细胞分裂、被放大轴通路感应 |
受体 | EGFR | 增殖感受体 | 酪氨酸激酶型受体,感知外界信号 |
激酶 1(Raf) | Raf | 启动激酶 | 激活 MEK,开始放大链路 |
激酶 2(MEK) | MEK | 中继激酶 | 级联中间酶,转导并放大信号 |
激酶 3(ERK) | ERK | 执行激酶 | 激活转录因子,最终执行细胞响应 |
转录因子(Elk1) | Elk1, c-Fos | 增殖信使 | 被激活进入核,促进细胞周期基因表达 |
信号终止(DUSP) | DUSP | 放大熄灭酶 | 去磷酸化 ERK 等,终止信号 |
元素 | 原术语 | 中文命名建议 | 功能说明 |
---|---|---|---|
通路名称 | Notch Pathway | 邻接决策通路 | 邻近细胞间“命运沟通”系统 |
配体(Delta) | Delta | 命运信号钥 | 激活邻近细胞 Notch 转接体 |
受体(Notch) | Notch | 命运转接体 | 受体被激活后剪切,释放信息段 |
ICD | Notch Intracellular Domain | 命运核信者 | 进入细胞核与 CSL 结合,决定命运 |
抑制因子(Numb) | Numb | 决策偏向因子 | 调节 Notch 活性分布,产生命运偏倚 |
模块 | 英文术语 | 中文命名 | 注释 |
---|---|---|---|
信号分子 | Hedgehog (Shh) | 区域通告因子 | 设定组织边界与形态轴 |
受体 | Patched | 区域抑制锁 | 抑制 Smoothened |
释放体 | Smoothened | 区域释放子 | 被解除后传导信号 |
信号转子 | Gli(转录因子) | 区域指令子 | 调控发育基因转录 |
抑制复合物 | SUFU、Kif7等 | 区域压制组 | 限制信号误激活 |
模块 | 英文术语 | 中文命名 | 注释 |
---|---|---|---|
细胞外因子 | IFNs, ILs | 因子投递物 | 如干扰素、白细胞介素 |
受体 | IFN-R, IL-R | 因子接收体 | 跨膜二聚体结构 |
激酶 | JAK1/2 | 桥接激酶 | 连通受体与STAT |
信使 | STAT1/3/5 | 核投邮子 | 被JAK激活后入核 |
调控子 | SOCS | 因子制动子 | 抑制信号正反馈扩展 |
模块 | 英文术语 | 中文命名 | 注释 |
---|---|---|---|
受体 | TNF-R, TLRs | 炎感受体 | 感应TNF、病原体等 |
激酶 | IKK | 炎核启动酶 | 激活 NF-κB |
抑制因子 | IκB | 核封锁子 | 束缚NF-κB不入核 |
转录因子 | NF-κB | 炎核激活子 | 控制免疫炎症基因表达 |
调节反馈 | A20, IκBα等 | 炎抑制子 | 终止负反馈环路 |
模块 | 英文术语 | 中文命名 | 注释 |
---|---|---|---|
感应模块 | MST1/2, SAV1 | 限控激活组 | 检测细胞密度 |
激酶 | LATS1/2 | 增殖熄灭酶 | 磷酸化 YAP/TAZ 抑制其活性 |
转录共激活物 | YAP / TAZ | 增殖释放子 | 入核促进器官生长 |
核内调控 | TEAD | 生长协同子 | 与YAP复合激活靶基因 |
上游感知 | 接触抑制、机械力等 | 限控线索因子 | 感应细胞接触状态 |
模块 | 英文术语 | 中文命名 | 注释 |
---|---|---|---|
受体 | GPCRs | 旋钮感受体 | G蛋白偶联型,感应激素、嗅觉、神经等 |
G蛋白 | Gαs / Gαi / Gαq | 循环激发子 / 停滞子 / 钙通子 | 激活不同信号模块 |
效应酶 | AC / PLC | 环合酶 / 磷裂酶 | 产生cAMP、IP3等次级信使 |
次级信使 | cAMP / IP3 / DAG | 环核子 / 钙裂子 | 快速激活后续信号响应 |
整合转录 | CREB, NFAT 等 | 周调控子 | 参与记忆、代谢、发育等转录调节 |
【信使类(信号分子)】 → [功能] + 信使 / 因子 (如 分化信使、生长因子)
【受体类】 → [功能] + 感受体 / 转接体 (如 极性感受体、命运转接体)
【激酶类】 → [功能] + 激酶 / 放大酶 (如 桥接激酶、中继激酶)
【转导子/转录调节因子类】 → [功能] + 核信使 / 传导子 (如 干性核信使、极性传导子)
【反馈调控类】 → [功能] + 熄灭酶 / 抑制因子 (如 增殖熄灭酶、命运回退因子)
特点 | 优点 |
---|---|
命名清晰 | 一眼看出通路与其元件的功能、位置、作用方向 |
避免冲突 | 每类元素使用统一结构,避免术语之间混用或歧义 |
易于扩展 | 加入新通路如 Hippo、PI3K、cGAS-STING 等时,直接延用该体系,结构不变 |
学术适用 | 可用于教学、论文中辅以括号注解;也适合在跨学科交流中消除术语障碍 |
合成生物适配 | 适合构建人工设计系统的模块标签命名,如用于可编程信号系统、CRISPR合成控制网络命名模板等 |
——为信号通路的组成模块建立一整套**学术性中文术语结构词典**,确保**不重复、功能明确、语义可扩展**
英文原名 | 中文标准命名 | 命名逻辑与解释 |
---|---|---|
MAPK | 放大轴通路 | 多级激酶放大机制(轴状) |
PI3K-AKT | 生存引导通路 | 控制细胞生长与生存 |
JAK-STAT | 因子信函通路 | 外部因子直送核内,快速调控 |
Notch | 邻接决策通路 | 一对一膜接触决定命运 |
Wnt | 极性坐标通路 | 空间/时间定位与组织极性构建 |
TGF-β/SMAD | 分化协调通路 | 组织分化/形态建构的信号轴 |
Hedgehog | 区域通告通路 | 建构“组织间边界与区域”的扩散信号机制 |
NF-κB | 炎症调控通路 | 炎症、免疫、应激信息的集中核内处理 |
Hippo | 生长限控通路 | 抑制异常增殖,决定器官大小 |
cGAS-STING | 病毒报警通路 | DNA泄露检测与抗病毒响应 |
GPCR-Gs/Gi | 循环转换通路 | G蛋白调控cAMP等次级信号调节代谢、感知等 |
Calcium | 钙信溢流通路 | 钙离子为信号传导核心的模块 |
> 例:极性坐标通路、生长限控通路、钙信溢流系统……
英文名称 | 中文命名模板 | 示例 | 命名逻辑 |
---|---|---|---|
RTK | 级联感受体 | EGFR:增殖感受体 | 可启动放大轴的受体 |
GPCR | 循环感受体 | β2AR:应急感受体 | G蛋白耦合型,调节环核苷酸、代谢等 |
Notch | 命运转接体 | Notch1 | 可接收邻近细胞命运激活信号 |
TGF-βR | 分化锁受体 | TGFβR I/II | 双重接合形成激活器,精确控制分化 |
Frizzled | 极性感受体 | Wnt受体 | Wnt特异识别受体,调节极性方向 |
STING | 核酸警觉体 | cGAS-STING配对 | 细胞质中检测病原DNA并激活免疫 |
Integrin | 锚点感受体 | β1-integrin | 整合细胞与外基质的接触并反馈方向或生长 |
英文名称 | 中文命名建议 | 功能逻辑说明 |
---|---|---|
JAK | 桥接激酶 | 连接受体与下游信使的中继激酶 |
Raf | 启动激酶 | MAPK 放大轴第一级,Ras 激活后启动链路 |
MEK | 中继激酶 | 连接 Raf 与 ERK |
ERK | 执行激酶 | 激活核内转录因子,驱动反应 |
AKT | 生存核心酶 | 抑制细胞凋亡、促进生长 |
mTOR | 合成调度酶 | 统筹营养与能量调控 |
GSK-3β | 极性重构酶 | 降解β-catenin,调节细胞极性 |
SMAD2/3 | 分化核信使酶 | 与受体协作转导信号进核 |
英文术语 | 中文命名建议 | 功能说明 |
---|---|---|
STATs | 因子信使 / 核转邮者 | 被JAK磷酸化后进入核启动转录 |
β-catenin | 命运传导子 | 稳定后进入核内,与TCF/LEF复合启动发育程序 |
SMADs | 分化核信者 | 接收TGF-β信号,调节转录反应 |
YAP/TAZ | 生长释放子 | 在Hippo抑制解除后进入核促进增殖 |
NF-κB | 炎核激活子 | 被IKK释放进入核内,诱导炎症与免疫基因表达 |
英文术语 | 中文命名建议 | 功能说明 |
---|---|---|
DUSP | 放大熄灭酶 | 去磷酸化ERK,关闭放大轴通路 |
SMAD7 | 分化阻断因子 | 抑制SMAD2/3与受体结合 |
Axin | 极性回收因子 | 与APC形成复合体降解β-catenin |
SOCS | 因子制动子 | 抑制JAK-STAT通路 |
PTEN | 生存制衡酶 | 拆解PIP3,阻断PI3K-AKT通路 |
类型 | 中文结构 | 示例 | 备注 |
---|---|---|---|
通路结构体 | “…通路” / “…轴” | 区域通告通路、生存引导轴 | 表示完整的信息流动系统 |
受体/蛋白命名 | “…感受体” / “…转接体” | 极性感受体、命运转接体 | 表示负责感应与传导的跨膜元件 |
酶类 | “…激酶” / “…熄灭酶” | 中继激酶、限控熄灭酶 | 动态调控或熄灭信号 |
次级信号 | “…因子” / “…核子” | 区域通告因子、环核子 | 分泌信号或胞内小分子 |
调控与反馈 | “…回收子” / “…制动子” | 极性回收因子、因子制动子 | 表示负调控、限幅功能 |
转录核心 | “…调控子” / “…核激活子” | 抗氧化调控子、炎核激活子 | 通常指调控特异基因表达的核心因子 |
未来若新通路/新蛋白被发现时,可使用如下结构命名:
<功能性质> + <所在层级名>
例如:
- “有丝启动酶”、“迁移调度酶”、“免疫核信者”、“溶菌感受体”、“代谢枢纽通路”、“线粒调和因子”
适用领域 | 用法 |
---|---|
替代抽象英文术语,提升学生理解与结构记忆 | |
用于细胞网络图、功能模块图中统一中文语义标注 | |
设计可编程信号装置时作为模块命名标准 | |
在注释或插图中统一术语,便于跨学科理解与跨语种沟通 |